Просмотр системных логов, настройка рабочего окружения, обновления и доработка кода сайтов дали свои результаты. Всё стало работать стабильнее, критических ошибок уже практически нет, повысилось быстродействие. Блекболыч вовсю готовится к новому серверу, потому что запускать кривой код на новом железе это ад и содомия.